关于港区富士康派遣工自离后是否有工资的问题，我们需要从劳动法和公司政策两个方面来分析。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者在没有按照法定程序提前通知用人单位的情况下擅自离职（即“自离”），通常情况下可能会对自身的权益产生影响。然而，这并不意味着劳动者将完全失去应得的报酬。

首先，劳动者有权获得其在实际工作期间内所付出劳动的相应报酬。即使是在未按正规流程办理离职手续的情况下，只要劳动者提供了实际的劳动服务，企业就有义务支付相应的工资。但需要注意的是，如果因擅自离职给用人单位造成损失，用人单位可以依法要求赔偿，这部分费用可能会从工资中扣除。

其次，具体到富士康这样的大型制造企业，其内部可能还会有更为详细且严格的员工手册或劳动合同条款来规范员工的行为与权益。因此，在遇到类似情况时，派遣工应当仔细查阅自己签署的劳动合同或相关协议，了解其中关于离职流程的具体规定，以便更好地维护自身合法权益。

最后，建议派遣工在决定离职前先与雇主进行沟通，了解清楚离职后的待遇及可能存在的风险，并尽可能按照正规程序办理离职手续，避免因操作不当而损害自己的利益。若遇到纠纷，也可以寻求劳动监察部门的帮助或通过法律途径解决争议。

总之，对于港区富士康派遣工而言，在自离的情况下，他们仍然有权获得已工作的那部分工资，但具体的处理方式还需结合实际情况和个人合同内容来确定。