《火影忍者》中，波风水门作为主角漩涡鸣人的父亲，在故事中的出现次数并不多。他的首次正式登场是在第四次忍界大战期间，具体来说是在动漫的第438集中，那时他被召唤出来作为“秽土转生”（Edo Tensei）的一部分，与宇智波带土进行战斗。
然而，水门的真正影响力和背景故事主要通过回忆片段展现给观众。例如，在漫画第24卷和动画第97集中，我们第一次通过鸣人与其他角色的对话了解到水门的存在。随后，在动画第160-161集中，我们看到了水门在第四次忍界大战前与长门（Pein）的战斗。这些回忆片段不仅揭示了水门的强大实力，还展示了他对儿子鸣人深深的爱以及对村子木叶村无私的奉献。
除了这些直接相关的集数外，《火影忍者》中还有许多间接提及或展示水门事迹的情节。尽管他作为角色的实际出场时间有限，但水门的形象已经深深烙印在了粉丝们的心中，成为了一个深受喜爱的角色。